العوامل التي تزيد من احتمال الإصابة بالتهاب المسالك البولية المتكرر عند الرجال والنساء بشكل عام وتجعل الحالة أكثر تعقيداً، وقد تؤثر على اختيار العلاج ومسار المرض:

1. الأشخاص المصابين بأمراض تؤدي إلى نقص وتثبيط المناعة مثل مرض السكري، السرطان، مرضى الكلى، مرضى زراعة الأعضاء.
2. الإصابة ببكتيريا مقاومة للمضادات الحيوية.
3. وجود اضطراب تشريحي في المسالك البولية.
4. وجود تسكير في المجاري البولية مثل وجود حصى في الحالب أو الكلية.
5. وجود قسطرة بولية عند المريض.
6. وجود اضطرابات في عملية افراغ البول مثل المثانة العصبية، وفي حالة مرض التصلب اللويحي

تشخيص التهاب المسالك البولية المتكرر

1. الفحص السريري وأخذ معلومات من المريض عن الحالة.
2. إعطاء تعليمات للمريض عن الطريقة الصحيحة لجمع عينة البول للحصول على أدق نتائج ممكنة.
3. عمل زراعة للبول للتأكد من نوع البكتيريا وأنواع المضادات الحيوية التي قد تستجيب لها.
4. عمل تحليل للبول للتأكد من التشخيص واستبعاد الاحتمالات الأخرى.
5. يمكن اللجوء للتصوير المقطعي وفحوصات أخرى غير روتينية عند الشك في وجود مشاكل أخرى قد تؤدي إلى تكرار حدوث التهاب المسالك البولية

مضاعفات التهاب المسالك البولية المتكرر

1. وصول البكتيريا إلى مجرى الدم وحصول إنتان أو التهاب في الدم(بالإنجليزية: Sepsis).
2. انتقال البكتيريا إلى الكلى وحصول مشاكل في الكلى قد تساهم على المدى الطويل في حدوث فشل كلوي.
3. زيادة احتمال الولادة المبكرة لدى المرأة الحامل وانخفاض وزن الجنين وما يرافقه من مشاكل قد تؤثر على صحة الجنين والأم.